【第01話】グリフォン復活
　イングラムと死闘を演じた黒いレイバーが佃島に出現した。
　２課は新型機ピースメーカーを出動させるが。

【第02話】災厄の日
　だれもが苦しむ虫歯。特に親知らずの虫歯ともなればなおさらである。
　そして、その災厄が野明を襲う。

【第03話】逆襲のシャフト！
　ゼロが破れ再起不能に陥った。そして、再びグリフォンは舞浜へ上陸する。
　迎かえ撃つイングラムだが。

【第04話】視聴率９０％
　長寿番組「お母さんとご一緒」の最終回の収録現場にレイバーが立て篭る。
　収拾に向かった第２小隊だが。

【第05話】史上最大の決戦
　２号機はダメージを受け、アルフォンスもバッテリーチェックの警告が。
　そこにグリフォンが飛びかかる。

【第06話】黒い三連星
　爆弾を持ったテロリストが銭湯に紛れ込む。犯人探しする第２小隊の男達。
　いったい犯人は誰なのか。手がかりは脇の下の黒い三連星。

【第07話】GAME OVER
　戦う野明、内海と再会する熊耳。３号機で支援に向かう香貫花。
　そして、ついにグリフォンとの決着がつく。

【第08話】火の七日間
　整備員の風紀の乱れに業をにやした榊班長は綱紀粛正を叫ぶ。
　反発する整備員たちはゲリラと化すが。

【第09話】VS
　第２小隊は香貫花を交え慰安旅行へ。
　しかし二人の女性の対峙が始まり、楽しい宴会場は修羅場と化す。

【第10話】その名はアムネジア
　太田が記憶喪失に。ただあてもなく街を彷徨う太田が見たものは、考えたことは。
　そしてたどり着く先は。

【第11話】雨の日に来たゴマ
　雨の中通勤してきた野明は２課棟入口で段ボール箱を見つける。
　そしてその中には小さな猫が入っていた。

【第12話】二人の軽井沢
　後藤と南雲は、軽井沢での研修の帰りに台風に道を塞がれる。
　どうしようもなくなった二人が行ったのは。

【第13話】ダンジョン再び
　２課を壊滅へ追い込んだ地下迷宮の王が再びダンジョンへ舞い戻る。
　好奇心は、人をダンジョンへと誘う。

【第14話】雪のロンド
　何が現実で、何が幻想なのか。
　かつての同級生、加嶋に久しぶりに再会した遊馬は彼女に何を見たのか。

【第15話】星から来た女
　野明はついに２課の秘密を知り、自分の本当の姿をも知る。
　今、地球は異星人の侵略の危機に瀕していた。

【第16話】第二小隊異常なし
　野明は遊馬から真実を伝えられる。確実に成長していた２課の面々。
　そして今日も２課の一日が始まる。